研发项目界定应吻合《重点支持技术领域》（详见《高企认定管理办法》），高新企业认定机构，从而归纳选定本企业申报高企的技术领域。研发项目所研发的技术目标既要体现行业先进性，也要结合企业实际。每年评审都否定一部分企业的低水平研发项目或编造不切实际的“前沿高水平”项目，项目对应的研发费用、成果转化也被剔除。如果企业在同一年度通过培育入库和出库的，还可同时享受入库奖补和出库奖补。
引导企业调整产业结构，巢湖高新企业认定，走自主创新、持续创新的发展道路，激发企业自主创新的热情，提高科技创新能力。企业通过自主研发、受让、受赠、并购等方式，获得对其主要产品（服务）在技术上发挥支持作用的知识产权的所有权。企业提交书面材料。经区市两级科信部门完成网上预审合格后，企业从网上申报系统下打印申请表及通知要求所有附件资料，按顺序装订成册一式一份，加盖公章，于报关至生产力促进中心。
在高新技术企业认定过程中要求企业技术产品或者服务的收入占企业总收入的60%，这里的收入当然不是说都是产品的收入，申请高新企业认定，还有其他的跟技术或者知识产权的收入也算在其中。主要产品(服务)是指高新技术产品(服务)中，拥有在技术上发挥支持作用的知识产权的所有权，且收入之和在企业同期高新技术产品(服务)收入中超过50%的产品(服务)。
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