次级处理的结果，可把原污水所含的有机物及悬浮固体除去80～95％。但经过次级处理后的污水中仍含有不同浓度的氮、磷等有机物及微生物。送入河川后，冶炼加工厂污水处理设备，仍会造成微生物的繁殖，而过度消耗水中的氧气，是故要维持河川的水质，好再进一步採用三级处理。
三级处理：三级处理是对水做更深度的处理，现今国内的污水处理厂投入实际应用的并不多。它是将经过二次处理的水进行脱氮脱磷，用活性炭吸附法或反渗透法等去除水中剩馀的污染物，并用臭氧或消菌，然后将处理水送入水道中。
在自然界中，河流与湖泊本身有很大的淨化能力，当污水流入河川之后，一部份有机物沉淀到河底，一部份就被水中的各种微生物消化掉，工厂污水处理设备维护，经过一段时间后，即能恢复成乾淨的水质。在大自然中，工厂地埋式污水处理设备，河流和湖泊都拥有一定的净化功能。当污水进入河流时，工厂污水处理设备，部分有机物会沉积在河底，而另一部分则被水生微生物分解。经过一段时间，水质通常会逐渐清澈。但由于大量人口聚集在都市地区，伴随着大量的污水排放，这使得自然环境难以应对。更进一步，工业废水中常含有的重金属，使得净化过程变得尤为困难。面对当下水资源的紧张，除了解决各种污水问题，如何高l效利用和节约水资源也成为了一个亟待关注的问题。
生物膜处理的初级处理：属机械性的，可分为三个部分：
（1）过滤：使较大的杂质直接被滤出。
（2）沉降：使污水流入沉淀池（Settling Tank），水中的悬浮物沉到池底，浮在水面的油质及泡沫分别收集到不同的地方，予以适当的处置。
（3）：沉淀池之后附设池（Flocculation Chamber），可加石灰把磷质分离，在池底的污泥则由抽水机送往初级消化池（Digester），把其中的有机物变成无臭及无害的泥状固体，将之晒乾，或由高压机压成泥块，可作为填土之用。
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