各国的杀菌条件虽不同，但大多国家全蛋液的标准是杂菌数5000 ～ 10000个／g以下，大肠菌群阴性/0.1g，沙门氏菌阴性／20 ～ 50 g。在蛋白液中加，使其在蛋白液中浓度达到0.0875%，保持3.5 min以上。随后加热至规定温度（51.7 ～ 53.3℃），台州蛋白液，保持2 min，巴士杀菌蛋清液，促进杀菌作用，然后冷却蛋清，再向蛋白液中加酶分解残留的。当蛋清pH为9时，巴氏杀菌蛋白液厂家，加热到56.7～57.2℃则黏度增加；加热到60℃时迅速凝固变性。可见，对蛋清加热灭菌时要考虑流速、蛋清黏度、加热温度和时间及添加剂的影响。
通常采用60~68 °C加热120~300 s的方式来对全蛋液进行巴氏杀菌。较低的温度杀菌导致微生物灭活不完全，而高温杀菌会诱导蛋白之间形成共价键，发生聚集，进而破坏全蛋液品质。与传统巴氏杀菌相比，磁感应加热温度曲线呈线性，无滞后现象，加热更具均匀性。通过水浴热传导的巴氏杀菌中，温度从60 °C（蛋清蛋白的变性温度）升高到68 °C（巴氏灭菌温度）的时间为110 s，巴士杀菌冷冻蛋白液，较感应加热多出20 s。在全蛋液的热处理过程中，巯基氧化形成二硫键，蛋白质发生聚集。新鲜全蛋液的DSC结果中60 °C、78 °C和83 °C处有三个吸热峰，分别对应为伴清蛋白，卵清蛋白和S-卵白蛋白的变性。
如何使全蛋液在营养、风味和品质都不受影响的情况下延长货架期，同时消除沙门氏菌等致病菌的污染是液态蛋品开发的关键。将去壳后的液体鸡蛋经一个蛋白和蛋黄分离机分为蛋白和蛋黄两部分，分别存储在相应的存储器中。沙门氏菌常作为巴氏杀菌下全蛋液的微生物指示菌。通过水浴加热和磁感应加热处理后，在60 °C下处理210 s，微生物菌落分别减少75%和84%。在68 °C下磁感应加热60 s，微生物减少95%，有效消灭全蛋液中的沙门氏菌。
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