Micro-CT 的主要应用领域：
骨骼：骨骼是Micro-CT 主要的应用领域之一，其中骨小梁又是主要研究对象，骨松质和青皮质的变化与骨质疏松、骨折、局部缺血和遗传疾病等病症有关。目前， Micro-CT技术在很大程度上取代了破坏性的组织形态计学方法。
牙齿及牙周组织：能够从3D整体结构出发，对管根形态改变、龋1齿破坏、牙组织密度变化、牙槽骨结梅和力学特性的变化等情况进行研究。
生物材料：例如，分析体外制备仿生材料支架的孔隙率、强度等参数，优化支架设计;扫描需要换的组织样晶，获取三维图像后输出为STL文件进行快速成形 (CAD/CAM) ，等等。
像素 像素（pixel）是构成CT图像的小单位，与体素相对应，体素的大小在CT图像上的表现，即为像素。 信噪（signal/noise ratio，SNR）即信号和噪声的比值。任何一种信号中都会包含噪声，但信号和噪声之间的比值不同。在实际应用中，该比值越大，噪声的含量就越小，信息传递的质量就越高。
噪声 在CT中，噪声（noise）是一均匀物质扫描图像中各点之间CT值的随机波动，也可看作是图像矩阵中像素值由于各种原因引起的误差。
大密度投影 投影是把三维信息压缩到二维的常用方法.大密度投影（maximum intensity projection，MIP）将三维数据向任意方向进行投影，假想有许多投影线，取投影线经过的所有体素中大的一个体素值，作为投影结果图像的像素值.在投影线上取小值，就成为小密度投影。前者多用于显示高密度影，如血管造影，后者多显示低密度影，如气道。
使用小动物/离体CT检测系统，采用锥形X射线，可以对不脱钙骨骼、动物牙齿、动物以及工业材料进行micro-CT检测服务，并为您分析其内部结果和提供给您高清晰、高质量的扫描图像。
micro-CT通常采用锥形射线束。采用锥形束不仅能够获得真正各向同性的容积图像，提高空间分辨率，提高空间分辨率，提高射线利用率，uCT公司，而且在采集相同3D图像时速度远远快于扇形束CT，本系统结合了高质量的扫描系统及全套的视图，分析和定量工具，适合广泛的应用领域。
研究对象通常为小鼠、大鼠或兔等动物，可以实现生理代谢功能的纵向研究，显著减少动物试验所需的动物数量；离体研究对象通常为离体标本（例如骨骼、牙齿）或各种材质的样品，可分析其内部结构和力学特性。
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