与传统国际物流相比，跨境电商物流是集产品、物流、信息流、资金流于一体的主动，需要有更高的敏捷性和柔性，强调其整合化和化能力，更注重IT 系统化和信息智能化。物流服务往往影响着消费者的整个购物流程和时效体验，跨境电商物流除了完成物品位移活动外，还能为消费者提供更多的增值服务。
跨境电商物流与传统国际物流、国内电商物流存在着发展起源、特点、业务模式、覆盖范围、运作流程、标准化程度、配送周期、运作成本、运作风险、信息技术等诸多方面都存在差异。
第三方物流自主管理的保税仓储业务，是近几年新推出的保税物流业务，是依据的保税货物进出口报关和完税的新型管理模式。在这种新型管理模式下，保税仓可以设在保税区外，海关下放部分操作程序，由第三方物流企业自主管理，长途运输服务，海关可以随时查看保税仓的库存情况，对保税仓实行监管。保税仓每月向海关申报一次货物进出口清单，并与海关系统核对保税货物的库存，一次完税，大大简化了进出关的手续，加快了通关速度。此种管理模式特别适用于对时间和库存要求比较高的维修备件的保税库存业务。
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