微生物检测是对食物进行卫生检查不可或缺的工作内容，更是发现食品卫生安全问题的重要环节。在把食品加工生产出来之后，质检人运用科学化的检验方法来评估食品卫生安全是否过关，通过保证检验质量和准确性为食品的生产者提供重要的工作依据。为维护食品行业的稳定持续与健康发展，提高人民群众的健康水平，代办生产许可证，必须重视食品微生物的检测，提高检测质量。
造成这种局面的根本原因是我们在食品安全管理中过分强调且依赖了检测的作用。即使检测方法很准确、检测样本很有代表性，但这种对产品的检测只能是事后发现问题食品，处理问题食品，却无法改变食品的安全性。因此，必须将食品安全检测延伸到食品生产企业，将检测作为工具，用于判断生产原材料、生产环境、生产工艺、包装材料、从业人员等各个环节是否能够保障食品的安全。这就好比一个患者测定血糖水平，其目的不在于知晓自身的血糖高低，而在于判断、饮食、运动等各个环节是否能够有效地控制血糖。
食品安全的含义有三个层次：层食品数量安全，即一个国家或地区能够生产民族基本生存所需的膳食需要。要求人们既能买得到又能买得起生存生活所需要的基本食品。第二层食品质量安全：指提供的食品在营养，卫生方面满足和保障人群的健康需要，食品质量安全涉及食物的污染、是否有毒，添加剂是否违规超标、标签是否规范等问题，需要在食品受到污染界限之前采取措施，预防食品的污染和遭遇主要危害因素侵袭。第三层食品可持续安全：这是从发展角度要求食品的获取需要注重生态环境的良好保护和资源利用的可持续。
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