植物原位杂交除了在遗传育种方面的应用，还在其他领域有着广泛的应用，包括：
植物基因表达模式研究：通过植物原位杂交技术可以检测特定基因在不同组织或不同生长条件下的表达模式，有助于了解基因的功能和作用机制。
植物基因组研究：植物原位杂交技术可以用于基因组研究，例如染色体构象、基因组变异和基因组进化等方面，有助于深入了解植物基因组的特征和结构。
将32 P标记的双链DNA探针于100℃加热5分钟，迅速置于冰浴中。单链探针不必变性。将探针加到杂交袋中杂交过夜。杂交期间，盛滤膜的容器应盖严，以防液体蒸发。
杂交结束后，去除杂交液，立即于室温把滤膜放入大体积（300-500ml）的2×SSC和0.1% SDS溶液中，轻轻振摇5分钟，并将滤膜至少翻转一次。重复洗 一次，同时应避免膜干涸。
68℃用300-500ml 1×SSC和0.1% SDS溶液洗膜两次，每次1-1.5小时。此时已可进行自显影。如背景很高或实验要求严格的洗膜条件，荧光原位杂交，可用300-500ml 0.2×SSC和0.1% SDS的溶液于68℃将滤膜浸泡60分钟。
生物领域应用原位杂交技术的例子：
物种进化与系统发生学研究：在物种进化与系统发生学研究中，原位杂交技术可以用于检测物种之间的亲缘关系和进化历程。例如，可以比较不同物种之间特定基因序列的差异，进而研究它们的亲缘关系和进化历程。
原位杂交技术在基因表达和调控、细胞分化与发育、研究和物种进化与系统发生学等领域都有广泛的应用价值，为深入探究生命现象、促进生物技术的发展提供了有力的技术支持。
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