信息系统之间缺乏接口标准，工商企业内部物流信息系统与第三方信息系统之间缺乏有效衔接，运输信息系统、仓储信息系统、物流作业管理信息系统之间互不沟通，由于没有公共物流信息交流平台，物流运输整车报价，以EDI互联网等为基础的物流信息系统难以得到实际应用。
在计划经济体制下，各个行业从上到下一统到底，行业之间、部门之间管理体系分割现象严重，物流运输整车企业，在向市场经济转型的过程中，习惯势力仍然有一定影响。物业的发展涉及到基础设施、物流技术设备、产业政策、投资融资、税收、海关、服务、与运输标准等多个方面，而这些问题的管理分属于不同的职能部门，各职能部门对现代物流认识不足和缺乏统一协调的战略思想，成为物业发展的主要瓶颈之一。
在条块分割、多头管理的传统模式影响下，我国各种物流基础设施的规划和建设缺乏必要的协调，因而物流基础设施的配套性、兼容性差，导致系统功能不强。各种运输方式之间、不同地区运输系统之间相互衔接的枢纽设施建设方面缺乏投入，对物业发展有重要影响的各种综合性货运枢纽、物流基地、物流中心建设发展缓慢。我国物流系统一般技术水平低，装备落后。在仓储设施方面，第三方物流企业拥有的仓库70%是普通平房仓库，现代化立体自动化仓储设施比例极低，具有冷藏、保鲜、气调功能的仓库更少。
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