亚细胞定位即指某种生物大分子物质或脂类在细胞内存在的具体位置。蛋白质在细胞质中经过翻译并合成，由蛋白质分选信号引导而被转运到特定的亚细胞结构中以参与细胞的各种生命活动，这一过程称为蛋白质亚细胞定位。蛋白质的功能、代谢以及相互作用等都与其亚细胞定位密切相关，成熟蛋白质必须在特定的亚细胞结构中才能发挥正确稳定的生物学功能，如果定位发生偏差，双分子荧光互补，将对细胞功能甚至生命产生重大影响，因此对蛋白质亚细胞定位的研究具有重要意义。
亚细胞定位是生物学中一个重要的研究领域，它帮助科学家们理解蛋白质和其它细胞成分如何在细胞内进行定位，这对于理解细胞的生物学和疾病研究都具有重要的意义。植物学研究者也利用亚细胞定位来研究植物细胞的生物学特性。
植物细胞的一个显著特点是它们具有细胞壁。细胞壁是由纤维素等多糖构成的，它包围在细胞膜的外面，提供细胞结构的支持。由于植物细胞壁的存在，植物细胞的亚细胞定位具有一定的性。
亚细胞定位原理
利用GFP、RFP等荧光蛋白具有的荧光性质和灵敏性，来示踪细胞内的蛋白。将目标蛋白与荧光蛋白的N端或者C端融合，通过瞬转或稳转，使该融合蛋白在受体材料细胞内表达，目标蛋白会牵引荧光蛋白一起定位到目标细胞器，经过激光共聚焦显微镜激光照射，荧光蛋白会发出荧光，通过观察荧光蛋白在细胞内显示的位置，从而可以确定目标蛋白的亚细胞定位情况，即可对蛋白质进行准确定位。
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