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硫酸铜杀病原体能力的大小常受水中各种因素影响，一般来说，其毒性随温度的升高而增强。随PH值的增加，有机物的增多，盐度的增多而使其毒性减小。硫酸铜的毒性与水温成正比，因此一般应在晴天上午使用效果较好，依水温相对减少用量。硫酸铜可以杀灭病原体的能力随着水体条件的变化而不同。一般来说，其毒性随着温度的升高而增强，随着pH值的增多、有机物的增多和的存在而减小。因此用药量应根据水条件的具体情况而灵活掌握。

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硫酸铜的作用机制主要是铜离子能与蛋白质中的巯基结合，干扰巯基酶的活性而达到对病原生物的致死作用。但在虾病暴发期间，硫酸铜溶液，如果多次使用硫酸铜消毒，使池内藻类全部，水清见底，反而会促使对虾迅速发病，上海硫酸铜，因而切不可乱用，必须慎重为好。硫酸铜水溶液对金属有腐蚀作用，不能用金属容器盛装溶解。溶解硫酸铜时水温不能超过60度，否则易失效。硫酸铜过量会引起鱼类组织坏死、造血组织破坏、肝脂肪增加，同时还可能残留在鱼类的鳃、肌肉和肝内，妨碍肠道的吸收，从而影响鱼类的摄食和生长，故不能经常使用。